Információ

Mit jelent az „Rb aktív állapotban van”?


Ciklinekről, cdk-ről és Rb-ről (retinoblasztóma) olvasok, és a terminológia egy része nem világos számomra.

Megértem, hogy amikor a CDK foszforilálja az Rb-t, akkor leválik az E2F-ről, és az E2F transzkripciós faktorként működhet. A kérdésem a terminológiára vonatkozik.

Kérdéseim a következők:

  1. Amikor az emberek azt mondják, hogy "Rb aktív", akkor azt jelenti, hogy "aktív = foszforilált állapot" (ahol az E2F mentes az Rb-től), vagy azt jelenti, hogy "aktív = nem foszforilált állapot"?

  2. Az „aktív ciklin” azt jelenti, hogy a ciklin csatlakozik a CDK-hoz, és a sejtciklus folytatódik? vagy "aktív ciklin = ciklin nem aktiválja a CDK-t és a sejtciklus szünetel"?

  3. Az aktív CDK azt jelenti, hogy a CDK-t a ciklin aktiválja, és a sejtciklus folytatódhat?

Általánosságban elmondható, hogy a kötés (Rb E2F-vel vagy Cyclin CKD-vel) aktiválást, a szétkapcsolás pedig inaktiválást jelent?

Kösz!

(A kép forrása: Kolch, Walter et al. "The role of Raf kinases in malignus transformation." Expert reviews in Molecular Medicine 4.8 (2002): 1-18.)


  1. Az „Rb aktív/inaktív” terminológia az E2F gátlására utal. Tehát az aktív Rb gátolja az E2F-et, míg az inaktív Rb nem gátolja az E2F-et.
    Ami az Rb-t és a foszforilációt illeti – a történet bonyolultabbnak tűnik ([1] az Rb-t rejtélyként írja le).
    A [2] szerint (ez az idézet az eLife cikkének összefoglalójából származik):

    Narasimha, Kaulich, Shapiro et al. most bemutatják az Rb fehérjék biokémiai elemzését, amelyek azt mutatják – teljesen váratlanul –, hogy a ciklin D komplex csak egy foszfátcsoportot ad az Rb-hez a G1 fázis során, bár ez a csoport hozzáadható a tizennégy különböző hely egyikéhez. Az így létrejövő „monofoszforilált” Rb-fajták mindegyike különböző transzkripciós faktorokat köthet le, és megakadályozhatja azok működését.
    A restrikciós ponton ezután gyorsan sok további foszfátcsoportot adnak hozzá, és az Rb fehérjét egy másik ciklin inaktiválja. Ez a ciklin, az úgynevezett Cyclin E, majd a sejteket a sejtciklus következő fázisába irányítja. A ciklin E aktiválódásának meghatározása a jövőbeli kutatások prioritása.

  2. + 3. A Wikipédia ciklinfüggő kináz (CDK) oldalán ez áll:

    Definíció szerint a CDK egy ciklinnek nevezett szabályozó fehérjéhez kötődik. Ciklin nélkül a CDK-nak csekély kinázaktivitása van; csak a ciklin-CDK komplex aktív kináz.

    A Wikipédia Protein kinase oldalán ez áll:

    A protein-kináz egy kináz enzim, amely más molekulákat, főleg fehérjéket módosít úgy, hogy kémiai úton foszfátcsoportokat ad hozzájuk (foszforiláció).

    És itt van egy szép vizuális magyarázat a Life: The Science of Biology-ból (10. kiadás):

    Tehát mind az "aktív CDK" és az "aktív ciklin-CDK komplex" (és a másik válasz szerint "aktív ciklin" is) arra az esetre utal, amikor a ciklin egy CDK-hoz kötődik, és így ciklin-CDK komplexet képez, pl. hogy a CDK valamilyen szubsztrátot foszforilálhat.
    (Nem szándékosan említettem itt a sejtciklust, mivel nem vagyok szakértő, ezért óvakodok attól, hogy egy aktív CDK mindig előre tolja a sejtciklust. Ha jól értem, még mindig nem tudjuk pontosan hogyan hatnak az egyes ciklin-CDK komplexek a sejtciklusra.)


Ami az utolsó kérdésedet illeti:

Általánosságban talán azt mondhatjuk, hogy a kötés (Rb E2F-el vagy Cyclin CKD-vel) aktiválást, a szétkapcsolás pedig inaktiválást jelent?

Mint fentebb említettük, ezt mondhatjuk a ciklinről és annak CDK-járól.
Sajnos ezt nem lehet általánosságban elmondani. Az E2F itt egy ellenpélda (le van tiltva, amikor Rb kötődik hozzá, és aktiválódik, ha az Rb leválik róla).
Általánosságban elmondható azonban, hogy amikor valami egy fehérjéhez kötődik, a fehérje megváltoztathatja az alakját, ami valamilyen funkció aktiválásához vagy gátlásához vezethet.


[1] Dyson, Nicholas J. "RB1: egy prototípus tumorszuppresszor és egy rejtély." Gének és fejlődés 30.13 (2016): 1492-1502.

[2] Narasimha, Anil M. et al. "A Cyclin D monofoszforilációval aktiválja az Rb tumorszuppresszort." Elife 3 (2014): e02872.


Rb: Az alulfoszforilált, az RB1 aktív formája kölcsönhatásba lép az E2F1-gyel, és elnyomja annak transzkripciós aktivitását, ami sejtciklus-leálláshoz vezet. (UniProt: P06400)

Ciklin-D: A ciklin D1-CDK4 (DC) komplex szabályozó komponense, amely foszforilál és gátolja a retinoblasztóma (RB) fehérjecsalád tagjai, beleértve az RB1-et, és szabályozza a sejtciklust a G1/S átmenet során. (UniProt: P24385)

Az aktív ciklin-D (azaz a ciklin-D komplexben CDK4-gyel) foszforilálja (vagyis inaktiválja) az Rb-t.


Nézd meg a videót: DR NESTOROVIĆ OTKRIO SVE O KARCINOMU:OVO VOĆE UNIŠTAVA ĆELIJE TUMORA MOZGA,JAJNIKA, PLUĆA I CREVA (Január 2022).